有研究报告显示，多伦多地铁的空气污染情况转差，空气污染物水平高于室外空气，其中以二号线（Line 2）的情况尤为严重。但是，当局仍鼓励民众继续乘搭地铁，因为这样有助环保。
该项研究由多伦多公共卫生局（Toronto Public Health）所做，卫生局医疗主任维娜医生（Dr. Eileen de Villa）在研究报告中指出，正如其他类似的地铁系统，多伦多地铁内的空气微粒污染物（PM2.5）水平有所上升。但她仍然认为，乘搭地铁“是一种健康的出行方式”，比开车更环保。
维娜医生的意见获得一些市议员的认同。TTC主席兼当河谷西选区（Don Valley West）市议员宾逊（Jaye Robinson）表示，虽然多伦多市民对报告所指的空气污染感到忧虑，但专业的公共卫生人员和运输官员均已明确表示，地铁仍是一种安全和有助环保的运输工具。
污染物与疾病风险有关
市议员周凯捷（Joe Cressy）亦指出，公共卫生局已对地铁进行过全面的健康风险评估，虽然与全球其他城市的地铁一样，多伦多地铁需要改善空气质素，但他相信地铁依然是“健康的出行选择”。
维娜医生在报告中提出多项建议，包括要求当局评估地铁的操作系统，例如自动列车控制及通风系统等。但她认为，对于评估PM2.5对地铁乘客构成什么健康风险，目前尚没有既定的标准或指引。
人类健康风险评估（HHRA）报告指出，在TTC地铁内测到的PM2.5污染物，与许多短期和长期健康问题有关，包括导致呼吸道及心血管疾病风险增加等。
TTC员工工会主席桑托斯（Carlos Santos）表示，公共卫生局的报告显示，地铁内出现明显的空气污染风险，但报告却没有提及地铁员工所面对的风险，证明当局没有正视员工的安全。
多伦多市长庄德利（John Tory）表示，TTC自1995年以来一直没有做过空气质素评估，这份研究报告提供了许多最新资料，有助未来的改善工作。
