颱風「珊珊」估計從周三開始日本九州或四國地方登陸，再貫穿整個日本，來勢洶洶。日本氣象協會表示，這個潛在強烈颱風前進速度緩慢，可能造成廣泛地區多日強烈降雨，九州地區更可能出現世紀豪雨，呼籲民眾提高警覺。日本航空（JAL）宣布在27日與28日取消合共過百航班，全日空（ANA）也指28日有可能會取消部分航班。
「珊珊」周一逼近日本西部，逐漸向九州方向移動，據報，從28日起，九州地區開始面臨歷史性大雨，至29日的48小時內，雨量估計高達600mm，比起現有紀錄高出150%。預報又顯示，從27日的早上6時到28日的早上6時，關東北部、南部的降雨量將達80毫米，關東甲信地區更達120毫米。若雨雲發展超過預期，出現警戒級暴雨的區域可能會擴大。
靜岡大學教授牛山素行預計，豪雨可能為相關地區造成大型災害，包括河道泛濫、土石流等，呼籲民眾提防。
事實上，因受不穩定天氣影響，關東北部栃木縣26日已率先遭大雨侵襲，鹽谷町的降雨量達到206毫米，創下有記錄以來最高降雨量，區內多處淹水。鹿沼市和日光市更發出土石流警報。
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為安全計，日本航空宣布取消27日往返鹿兒島和奄美大島的39個航班，28日往返鹿兒島和奄美大島等地83個國內線和國際線，以及部份往返名古屋中部與大阪關西機場的航班也暫停。
全日空（ANA）表示，28日往返九州的航班亦可能會被取消。
JR鐵路線各公司周一上午宣布，各幹線從周三（28日）開始到周六會進行計劃性停駛，呼籲乘客出發前先查詢班次資訊。東海道新幹線周三至周四、山陽新幹線周三至周五之間，全線或部分區間可能會出現停駛或長時間誤點的情況；九州新幹線則可能在周二後停駛。
JR東日本指出，從周三至周四為止，以上越新幹線和北陸新幹線為中心的各個路線，很可能出現停駛或大幅誤點，預計會隨着颱風行經的路線進行調整。
