據梵蒂岡在每日公告中表示，教宗方濟各於周六先後召見兩位常駐梵蒂岡的加拿大籍樞機主教切爾尼(Michael Czerny)及韋萊(Marc Ouellet)。儘管梵蒂岡並未有透露會議中談及的議題，但有外交人員認為，該次會議有可能與本國日前熱論的原住民寄宿學校有關。
發現215名兒童遺骸的甘碌市原住民寄宿學校，於1890年至1969年開設，由天主教會運營，曾經是全國最大的原住民寄宿學校。加拿大約有47%的寄宿學校是由無玷聖母獻主會 (Missionary Oblates of Mary perfectulate)開辦，包括甘碌市的這所寄宿校。
對於甘碌市（Kamloops）前寄宿學校舊址發現的215具兒童遺骸，許多加拿大國民呼籲教宗，應為天主教會當年運營原住民寄宿學校的事件道歉。當年約15萬名第一民族、梅蒂斯人和因紐特人兒童被迫送入教會經營或政府資助的寄宿學校。
曾對美洲殖民行為道歉
2013年當選教宗的方濟各，對美洲的殖民行為曾作出道歉，但有指方濟各通常只會在出訪其他國家的時候才作出道歉，而他並沒有訪問加拿大的計劃。在2015年，教宗出訪玻利維亞時曾以上帝的名義，對美洲原住民犯下的許多嚴重罪行作出道歉。
加拿大的寄宿學校系統強行將大約15萬兒童與其家人分離，許多兒童在學校遭受了虐待、強姦或未給予足夠營養，真相與和解委員會（Truth and Reconciliation Commission）在其2015年的報告中稱這種做法為「文化種族滅絕」。加拿大政府於2008年正式就原住民寄宿學校向原住民社區道歉，並且協商成立了「原住民真相與和解委員會」。
總理杜魯多周五表示，天主教會應對原住民寄宿學校出現的問題承擔責任，並作出正式道歉。杜魯多稱：「過去多日來，許多像我一樣的天主教徒一直想知道，為什麼加拿大的天主教會保持了沉默，沒有站出來，沒有表現出領導力。」
